Политик оспаривает санкции, введённые против него Канадой, утверждая, что исторически выступал против президента России и покинул страну в 2022 году после начала спецоперации на Украине.
В июне 2025 года после саммита G7 власти Канады объявили новые санкции против России, включающие ограничения для физических лиц, в числе которых оказался и Чубайс.
В апреле того же года «Роснано» подало иск на сумму 5,6 миллиарда рублей к Чубайсу и семерым его бывшим топ-менеджерам, проживающим за пределами России. Иск связан с убытками по проекту Plastic Logic, который финансировался корпорацией, но не достиг заявленных целей — создания производства гибких планшетов в РФ и их внедрения в образовательные учреждения. Рассмотрение дела в суде проходит в закрытом режиме.
В сентябре 2023 года президент Владимир Путин заявил, что Чубайс «удрал» из страны и теперь «он уже не Анатолий Борисович, а Мойша Израилевич». Глава государства не исключил, что отъезд Чубайса мог быть связан с его деятельностью на посту главы «Роснано».