Проведенные на мышах эксперименты показали, что после трансплантации донорских фекальных масс микроорганизмы могут попасть в другие отделы кишечника, что может нарушить его работу. ДеЛеон подчеркнул, что хотя результаты исследования были получены на мышах, а не на людях, они все равно указывают на необходимость осторожности при проведении данной процедуры. Пересадка фекальной микробиоты считается эффективным методом восстановления кишечной микробиоты, но потенциальные риски требуют дальнейшего изучения.