Его подозревают в организации взрыва автомобиля гендиректора «Балтийского судомеханического завода» Игоря Малькина в 1998 году. Иванов, по мнению следствия, являлся заказчиком и инициатором преступления, изготовив сам взрывчатку, использованную при атаке. После допроса у следователя Иванову стало плохо, и его доставили на обследование в НИИ скорой помощи имени Джанелидзе. Согласно данным Следственного комитета России, в июне 1998 года трое преступников, выдававших себя за сотрудников милиции, остановили автомобиль, в котором находились гендиректор и его заместитель. Под видом проверки документов они подложили взрывное устройство в салон машины, которое затем было подрывное. В результате взрыва водитель погиб, а топ-менеджеры завода были госпитализированы. Ранее в ноябре был задержан Иванов с оружием, а в мае был арестован экс-полковник Михаил Смирнов, также обвиняемый в убийстве журналиста в 2004 году.